MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	ACG	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017377	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017377	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017377	T	7	7	1582	1588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017377	ATT	2	6	1622	1627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017377	TAA	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017377	AAT	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017377	A	7	7	1902	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017377	TAAA	2	8	1919	1926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017377	A	6	6	1924	1929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017377	GTC	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017377	G	6	6	2018	2023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017377	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017377	G	6	6	2082	2087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017377	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017377	TC	3	6	2158	2163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017377	GTT	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017377	CTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017377	TCCTTG	2	12	2986	2997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017377	CTA	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017377	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017377	TGT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017377	TTG	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017377	CT	3	6	3199	3204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017377	T	6	6	3232	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017377	TAG	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017377	GTT	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017377	GTT	3	9	3273	3281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017377	GA	3	6	3304	3309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017377	TGT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017377	TCA	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017377	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017377	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017377	CCTTG	2	10	3504	3513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017377	TAT	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017377	TGT	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017377	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017377	TAG	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017377	TC	3	6	3793	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017377	TG	3	6	3847	3852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017377	TGT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017377	CAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017377	CA	3	6	3976	3981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017377	TGAG	2	8	3995	4002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017377	AG	4	8	4001	4008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017377	TTAG	2	8	4019	4026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017377	G	7	7	4515	4521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017377	ATTTT	2	10	4607	4616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017377	GTT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017377	TGAT	2	8	4655	4662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017377	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017377	GAAT	2	8	5265	5272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017377	ATC	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017377	TGAA	2	8	5306	5313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017377	ATT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017377	A	7	7	5387	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017377	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017377	ATCA	2	8	5471	5478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017377	AGCG	2	8	5499	5506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017377	TAAAAC	2	12	5693	5704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017377	GTT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017377	TTA	2	6	5738	5743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017377	T	6	6	5765	5770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017377	GC	4	8	5785	5792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017377	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017377	GGA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017377	AG	3	6	6106	6111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017377	AGG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017377	TTAT	2	8	6220	6227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017377	TTA	2	6	6267	6272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017377	GAA	2	6	8625	8630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017377	TAC	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017377	CT	3	6	9398	9403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017377	TCATT	2	10	10859	10868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017377	A	6	6	10870	10875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017377	T	6	6	10892	10897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017377	A	7	7	10916	10922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017377	TAAA	2	8	10933	10940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017377	A	6	6	10938	10943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017377	GTC	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017377	G	6	6	11032	11037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017377	TTC	2	6	11057	11062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017377	AC	3	6	11085	11090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017377	TTA	2	6	11096	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017377	TAA	2	6	11117	11122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017377	G	7	7	11623	11629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017377	ATTTT	2	10	11715	11724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017377	GTT	2	6	11757	11762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017377	TGAT	2	8	11763	11770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017377	TTC	2	6	12354	12359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017377	GAAT	2	8	12373	12380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017377	ATC	2	6	12402	12407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017377	TGAA	2	8	12414	12421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017377	ATT	2	6	12449	12454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017377	A	7	7	12495	12501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017377	CTT	2	6	12502	12507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017377	ATCA	2	8	12579	12586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017377	AGCG	2	8	12607	12614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017377	CAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.